ภายในปีการศึกษา 2569 โรงเรียนวัดมงคลวราราม ยังคงนำกิจกรรมจิตศึกษามาใช้ในการเรียนการสอนซึ่งมีต้นแบบมาจาก โรงเรียนลำปลายมาศ จังหวัด บุรีรัมย์  โดยมีกิจกรรมในโรงเรียน ช่วงเช้า จะเป็นกิจกรรมจิตศึกษา ก่อนการเรียนการสอน หลังจากนั้นจะมีกิจกรรม ช่วงพักเที่ยง จะเป็นกิจกรรม Body Scan ส่วน ช่วงเย็น จะเป็นกิจกรรมจัดกายจัดใจ เป็นกิจกรรมก่อนเลิกเรียน และ ทุกวันอังคาร มีกิจกรรมการเรียนรู้โดยใช้ปัญหาเป็นฐาน (PBL) โดยใช้เวลา 2 ชั่วโมง เป็นการเรียนรู้ที่นักเรียนได้ลงมือปฏิบัติจริง